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一文初步學會Meta文獻檢索 | Meta簡明教程

原創
2019-12-08  妙趣橫生...
Meta簡明教程(2)

當找到一個臨床問題,那么就要動起來,你要在浩瀚的數據庫中找到能解決你這個問題的證據,第一步就是文獻檢索,找出與提出臨床問題相關的文獻。本篇對文獻檢索的過程和檢索策略進行介紹,相信諸位學完之后,就能初步掌握Meta分析的文獻檢索過程。

我們將以研究主題“臨床試驗評價他汀類藥物治療房顫療效”為例,按部就班、簡明扼要地教大家如何進行文獻的檢索。

一、選擇數據庫


一般而言,要解決提出的臨床問題,我們優先選最為相關的數據庫進行文獻檢索,如果找不到足夠的文獻,那再找其它數據庫進行二次檢索。但meta的綜旨是要把提出臨床問題相關的研究都找到(不管陽性陰性),現在借助于計算機檢索和noteexpress等文獻管理軟件,我們可以一次性對多個數據進行檢索,所以現在的meta分析一般不去關注什么才是最相關的數據庫,只要和我提出臨床問題相關的數據庫,只要有時間精力,一股腦兒全都進行檢索,然后再依次進行重復剔除和篩選,這么做,找到的文獻會更加全面。

Meta分析主流檢索數據庫如下:

中國知網:http://www.cnki.net/old/

萬方:http://www.wanfangdata.com.cn/index.html

Pubmed: http://www.pubmed.com/

Embase:https://www.embase.com/login

Web of science: https://www.webofknowledge.com

cochrane library:https://www.cochranelibrary.com/

Scopus:https://www.scopus.com/

中文醫學的meta論文: 建議大家選擇 中國知網,萬方,維普、中國生物醫學、Pubmed, Embase, web of science,cochrane library,Scopus

英文醫學的meta論文:建議大家選擇 Pubmed, Embase, web of science, cochrane library、Scopus

一般這幾個數據庫就差不多了,如果還有需要,可以搜索Google Schoolar等。

要開展meta分析數據庫,并非所有的數據庫都需要涉及,畢竟部分數據庫國內一些普通研究機構沒有購買,所以得到相應文獻的信息很難。我希望諸位朋友真要開展英文的SCI論文的話,也要排除萬難,盡量獲得多一些的數據庫檢索權。

二、確定檢索詞進行檢索


1. 確定檢索詞的方法

選擇恰當的檢索詞能提高檢索臨床問題證據的相關性。檢索詞獲得有兩種,一種是自由詞,根據臨床問題自己設定檢索詞。

比如我要了解他汀類藥物治療房顫的效果,檢索詞可以是(他汀房顫)。首先以自由詞方法設定檢索詞“他汀”,“房顫”,“statins”,”atrial fibrillation”,可以通過過綜述或關鍵詞,找到意思相同但表達不同的詞(他汀:3-羥基-3甲基戊二酰輔酶A(HMG-CoA)還原酶抑制藥)。

這里推薦另外一種檢索詞確定方法:主題詞(MeSH術語),一般可以通過pubmed上進行搜索獲得。

2.以主題詞進行檢索

1)主題詞檢索

在主題詞(MeSH)檢索中,發現statins意思相同的表達形式(Hydroxymethylglutaryl CoA Reductase Inhibitors;Inhibitors, HMG-CoA Reductase;HMG-CoAReductase Inhibitors)

Atrial Fibrillation 不同表達形式:AtrialFibrillations, Auricular Fibrillation

2)選擇不同表達形式的檢索詞

通過Mesh找到不同表達詞(可適當選擇檢索詞)

Statins: Hydroxymethylglutaryl CoA Reductase Inhibitors,Inhibitors, HMG-CoA Reductase,HMG-CoAReductase Inhibitors

Atrial fibrillation: Atrial Fibrillations, Auricular Fibrillation,Fibrillation, Auricular

3)確定檢索式

搜索的文獻不足,可增加檢索詞表達詞,用“OR”連接不同表達形式詞

Stains檢索式可以為Statins OR HydroxymethylglutarylCoA Reductase Inhibitors OR Inhibitors OR HMG-CoA Reductase OR 

HMG-CoAReductase Inhibitors

Atrial fibrillation檢索式:Atrial fibrillation ORAtrial Fibrillations OR Auricular Fibrillation OR Fibrillation, Auricular

最終檢索式可以為:

 ((Statins ORHydroxymethylglutaryl CoA Reductase Inhibitors OR Inhibitors OR HMG-CoAReductase OR HMG-CoA Reductase Inhibitors)) AND (Atrial fibrillation OR Atrial FibrillationsOR Auricular Fibrillation OR Fibrillation, Auricular)

4)數據庫檢索

Pubmed搜索: 可以看到能檢索到5729篇文章,再對研究類型進行篩選“Clinical trial”,最后剩下562篇

Embase搜索, 可以查到4114篇文章, 然后篩選臨床研究,最后剩下1486篇

值得注意的是:不同檢索策略結果不一致,可能有些時候可能產生幾千甚至上萬的文獻,有些時候產生寥寥無幾不到上百篇文獻,因此正式確定檢索詞之前,要嘗試增加或檢索詞、調整檢索區域、控制研究類型以獲得適當文獻量,最終形成正式的檢索詞,開展檢索獲得相應的文獻。

三、文獻導出


搜索到的文獻可以把題錄批量生成文件,導入到noteexpress(noteexpress軟件可見本號之前的軟件下載合集:重磅推薦:分類最全的統計分析相關軟件,了解以下?請關注、收藏以備用

Pubmed:一次只能導出200篇,所以只能多導出多個文件,再到noteexpress融合。Send to>citationmanager>create file

Embase:可一次性導出所有文章; selected>export

四、重復文獻的剔除


將導出文件導入到noteexpress,并完成重復文獻的剔除(重復文獻要多次篩選剔除)。

1)  查找重復題錄,第一次查重可以嚴格限定條件,區配度調高,進行一次初篩,將重復題錄刪除

2)因為同一篇文章在不同數據庫的表達方式不同,第一次查重不能完全刪除。進行第二次查重,可減少查重字段的條件,調低匹配度。

3)如果第二次查重刪除后,還有重復題錄,可再減少查重字段,調低匹配度,直至沒有重復題錄。記住匹配度不能一次性調的太低,不然一些相似的題錄會被當成重復題錄刪除。

五、小結


Meta分析文獻檢索并非難事,但也需要一定的技巧、不斷地嘗試。不同策略得到的結果可能會存在著一定的差別。雖說Meta分析希望能夠得到全部所有的相關文獻,但是過泛的檢索策略將給后期有效文獻的篩選帶來巨大的工作量。因此,檢索條件的適度寬泛還需要諸位自身憑專業進行把握。

Meta分析往期文章:

1.認識一下meta方法! | 系列文章meta分析

2.率的meta分析:神藥PD-1、PD-L1抑制劑的不良反應研究

諸位,本公眾號現在已經形成包括“樣本量估算方法”“論文的統計表達方法”“統計視頻”(R、醫學統計學、妙趣統計學)、“科研工具合集”、“如何分析真實世界臨床研究數據”、“Meta分析”等系列,有興趣同仁們可以關注。


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